Les localisations urbaines sur ce fond de carte du relief et des altitudes permettent d'établir une relation avec des milieux naturels qui favorisent ou non la  qualité de l'air. Les villes du grand Ouest atlantique, largement ouvert sur l'océan et ses vents d'ouest dominants, bénéficient ainsi de moindres risques de pollution à l'exception de la Zone Industrialo-Portuaire du Havre. Au contraire, les agglomérations en position d'abri, au pied de reliefs ou dans des cuvettes qui annihilent les vents d'Ouest, sont particulièrement soumises aux calottes de pollution durable.

  L'indice ATMO est un  Indice de Qualité de l'Air pour les agglomérations de plus de 100 000 habitants. Il est calculé tous les jours (Décret relatif à l'indice de qualité de l'air du 10 janvier 2000, en vigueur depuis le 18 mars 2000). Il permet de caractériser, sur une échelle de 1 à 10, la qualité de l'air globale d'une agglomération. 
  Il est construit à partir de 4 sous-indices pour les indicateurs suivants:
  - Le dioxyde de soufre (SO₂)
  - Le dioxyde d'azote (NO₂)
  - L'ozone (O₃)
  - Les poussières fines (PF)
  L'ozone est le principal responsable de la mauvaise qualité de l'air. Il détermine dans plus de la moitié des cas la valeur de l'indice Atmo, essentiellement à partir de mars. Le dioxyde d'azote et les poussières fixent l'indice lors de situations météorologiques particulières, surtout en hiver. Par contre, le dioxyde de soufre détermine rarement l'indice.

En 2002, en moyenne sur 57 agglomérations, la qualité de l'air a été très bonne (indices 1-2) pendant 5,5% des jours de l'année où l'indice Atmo a pu être calculé, bonne (3-4) pendant 73,4%, médiocre (5-7) pendant 20,8% et mauvaise (8 à 10) pendant 0,3%.

  Depuis 2003, un site internet  permet de suivre "en direct" la pollution de l'air en Europe et en France: http://www.prevair.org/introduction.php . PREV'AIR a été mis en place à l'initiative du Ministère de l'Ecologie et de Développement Durable (MEDD) .Des cartes de la qualité de l'air et de la teneur en ozone sont constamment mises à jour avec  prévision pour le lendemain. 

  À Besançon, les mesures sont assurées par l'ASQAB (Association pour la Surveillance de la qualité de l'air à Besançon) sur quatre sites: Chailluz, Palente, Planoise et rue Mégevand.